Impacts of Deforestation and Climate Change on the Spatial Distribution of Human Rabies and Oropouche Fever Cases in the Amazon (Conservation International Progress Report 2024 — Study 03)
1. Dr. Marco Aurelio Pereira Horta
Biosafety Level 3 Facility, Oswaldo Cruz Institute, Fiocruz, Rio de Janeiro, Brazil
2. Dr. Klauss Kleydmann Sabino Garcia
Núcleo de redação — Análise da distribuição espacial de doenças infecciosas
2024-12-01
Resumo
First-version ensemble niche modeling (biomod2: GLM, GAM, CTA, FDA, MARS, RF; 80/20 cross-validation) of human rabies (SINAN, 2001–Aug/2023), Oropouche fever (2023, via LAI/Fala.BR) and rabies-positive bat species in the Legal Amazon, using CHIRPS dry days, CDD, anomalous accumulation (2000–2023) and LST (2001–2020; SSP2_RCP4.5, SSP3_RCP7.0).
Desempenho dos ensembles (declarado)
| Desfecho / variável | AUC | Sens. | Espec. |
|---|---|---|---|
| Raiva — dias secos | 0.866 | 83.33% | 87.57% |
| Raiva — CDD | 0.850 | 82.5% | 57% |
| Raiva — LST | 0.888 | 82.76% | 82.76% |
| Morcegos — dias secos | 0.855 | 58.82% | 80.87% |
| Morcegos — CDD | 0.950 | 97.05% | 88.625% |
| Morcegos — LST | 0.724 | 78.08% | 58.63% |
| Oropouche — dias secos | 0.657 | 50.289% | 73.874% |
| Oropouche — CDD | 0.883 | 83.81% | 71.17% |
| Oropouche — LST | 0.911 | 97.83% | 77.88% |
Tabela 1 — AUC por algoritmo (Raiva / Morcegos)
| Variável | GLM | GAM | CTA | FDA | MARS | RF |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Raiva dias secos | 0.855 | 0.860 | 0.869 | 0.871 | 0.864 | 0.880 |
| Raiva CDD | 0.830 | 0.835 | 0.840 | 0.842 | 0.837 | 0.845 |
| Raiva acumulação anômala | 0.684 | 0.736 | 0.714 | 0.735 | 0.720 | 0.780 |
| Raiva LST | 0.789 | 0.850 | 0.786 | 0.861 | 0.866 | 0.900 |
| Morcegos dias secos | 0.603 | 0.737 | 0.688 | 0.658 | 0.785 | 0.997 |
| Morcegos CDD | 0.711 | 0.801 | 0.766 | 0.728 | 0.885 | 0.991 |
| Morcegos acumulação anômala | 0.703 | 0.851 | 0.745 | 0.738 | 0.985 | 0.988 |
| Morcegos LST | 0.666 | 0.704 | 0.689 | 0.699 | 0.736 | 0.997 |
Tabela 2 — AUC por algoritmo (Oropouche)
| Variável | GLM | GAM | CTA | FDA | MARS | RF |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Dias secos | 0.616 | 0.650 | 0.648 | 0.620 | 0.678 | 0.710 |
| CDD | 0.760 | 0.762 | 0.672 | 0.762 | 0.784 | 0.882 |
| Acumulação anômala | 0.645 | 0.654 | 0.873 | 0.645 | 0.814 | 0.913 |
| LST | 0.685 | 0.736 | 0.778 | 0.736 | 0.684 | 1.000 |
Inconsistências de origem
O resumo diz que os focos de raiva estão no sul e os de Oropouche no nordeste; a Fig. 1 descreve maior densidade de raiva no nordeste. RF com AUC 1.000 sugere sobreajuste. "CMIP5" citado junto a cenários SSP.
Mapas do documento (não reproduzidos)
Fig. 1 e 12: pontos de casos (centroides municipais, coordenadas não listadas no PDF); Figs. 2–11, 13–18: rasters de adequação.